No se conocen bien las causas por las que aparece el nevus de Becker, pero parece tener relación con sensibilidad a los andrógenos puesto que afecta principalmente a hombres al comienzo de la adolescencia.
Los andrógenos son hormonas sexuales fundamentalmente masculinas que participan en el desarrollo de los caracteres sexuales secundarios masculinos (barba, vello en pubis, cambio de la voz, etc.).
También aumenta la incidencia del nevus de Becker tras exposición prolongada al sol.
Es mucho más frecuente en hombres que en mujeres (5 casos en hombres por cada caso en mujeres). Se calcula una incidencia total de 5 casos por cada 1000 habitantes en hombres.